Όσον αφορά τον Εργαστηριακό Τομέα, λειτουργούν τα παρακάτω εργαστήρια:

• Μικροβιολογικό, εντός του οποίου πραγματοποιούνται και βιοχημικές εξετάσεις
• Αιματολογικό, στα πλαίσια του οποίου λειτουργεί και η αιμοδοσία του νοσοκομείου
• Παθολογοανατομικό, εντός του οποίου πραγματοποιούνται και κυτταρολογικές εξετάσεις
• Ακτινολογικό, στο οποίο θα ενταχθεί και η λειτουργία του υπό προμήθεια αξονικού τομογράφου
• Στον Εργαστηριακό Τομέα της Ιατρικής Υπηρεσίας ανήκει επίσης, ως αυτοτελές και ανεξάρτητο τμήμα το νοσοκομειακό φαρμακείο.